Munakoison hedelmäliha on vaaleaa ja hiukan sienimäistä. Maku on mieto ja neutraali. Se pääsee oikeuksiinsa vasta kun munakoisosta valmistetaan ruokaa. Munakoiso sopii hyvin kasvismuhennoksiin, pata- ja laatikkoruokiin. Laatikkoruoista ehkä tunnetuin on kreikkalainen musaka ja pataruoista ranskalainen ratatouille. Munakoiso sopii myös grillattavaksi marinoituna. Munakoiso on kylmänarka, alle 7 asteen lämpötilassa se paleltuu ja hedelmään tulee ruskeita laikkuja. Ihanteellinen säilytyslämpötila on +8 - +12 astetta.